Раздельный учет НДС

[ааааааа]

Здравствуйте, вопрос касается раздельного учета НДС. Мы мед.учреждение и выручка от операций не облагаемых НДС (медицинские услуги) составляет 95% от общей выручки, а 5 % - от операций облагаемых НДС (розничная торговля медикаментами, аренда, ксерокопия). Аудитор после проверки сделал замечание об отсутсвии ведения раздельного учета по НДС. И действительно, начав разбираться с этим делом (работаю недавно), предидущий гл.бух сказала, что никогда не выделяли НДС, а принимали суммы общехозяйственных и общепроизводственных расходов включая НДС. С чего начать и как правильно исправить ситуацию? Я начинающий бух. Заранее спасибо.