Погашение аванса

[Юлика68]

Уважаемые коллеги!Прошу помощи!
В договоре подряда предусмотрено погашение аванса пропорционально оьъемам выполненных работ.Например :Сумма договора - 1000000, аванс 30% - 300000,00.
В первый месяц выполнили работ на 500000,00.
В КС-3 (акт о стоимости выполненных работ) указали - зачет аванса - 30% -150000,00.А в бухгалтерском и налоговом учетах бухгалтер засчитал в погашение все 300000,00, мотивируя это устной консультацией аудитора.
Я считаю, что мы:
1)нарушаем условия договора;
2)ведем бухгалтерский учет не на основании первичных документов, а на основании не понятно чего;
3)недоплачиваем НДС в бюджет.
А суммы авансов у нас - мама не горюй.
У кого-нибудь есть такие договора, и есть ли ссылка на какие-либо нормативные акты, как сделать правильно?