Хочу разобраться - один налог, но разные инстанции

[Chrom]

Давиче столкнулся с такой ситуацией: торговая фирма (г. N) открыло представительство в г. M. При этом со слов бухгалтера возникла необходимость сдавать отчетность по налогам (скажем с ФОТ или Налог на имущество) в инстанции разных городов. К примеру по ФОТ часть сотрудников сдается в г.N, а часть в г.M - для меня это до сих пор остается неясным. А постольку-поскольку я программист, то мне приходится зачастую самому готовить к выгрузке 2НДФЛ и прочее.

P.S. Представительство, филиал, обособленное подразделение - между ними существует разница?