НДС по фирме-однодневке являющейся и покупателем и продавцом

[Злата Хрусталева]

Незнаю с кем посоветоваться по вопросу НДС.
У нас проходит налоговая проверка, которая выявила, что мы покупали товар у контрагента не зарегистрированного в качестве юридического лица, и соответственно не законно возместили НДС.
Но в тоже время этот контрагент являлся не только нашим поставщиком, но и покупателем, и на реализованный ему товар мы начислили НДС. Сумма начисленного НДС, превышает сумму возмещенного НДС. Мое мнение даже если фирма и не существует в любом случае бюджет не пострадал.
Посоветуйте, если шансы в споре с налоговой по этому вопросу?