Помогите, как правильно оформить

[Силам]

Нами в июле были выполнены работы по договору на сумму 500 тыс. руб. Счет, счет-фактура, КС-2, КС-3 все отправлено Заказчику, но с подписями формы КС-2, КС-3 так до сих пор и не получены. По договору нами был получен аванс в размере 400 тыс. руб. И вот зависает сумма 100 тыс.
Сегодня приходит дополнительное соглашение к договору со следующей формулировкой: "в связи с тем что объем выполненных работ фактически сокращен, то стороны пришли к соглашению уменьшить стоимость выполненных работ на 100 тыс." На самом деле уменьшения объема работ не было, просто они не хотят и не могут нам заплатить эти 100 тыс. т.к. куда то их использовали (это все деньги бюджетные). Наш директор доброй души человек подписал это доп. соглашение и принес мне на стол. Что мне делать? как все это можно отразить в бух. и налоговом учете (предприятие на ОСНО) ? Вообще правомерно ли все это? Если кто сталкивался с подобным напишите. Спасибо.