отсутствие документов при проверке

[Youlia]

Не захотят, но проверить придется. Проверки при ликвидации - обязательны.

При ликвидации проверки НЕ обязательны. Тем не менее, стоит подождать еще годик, т.к.

Фирма не имеет деятельности уже 2 года

, чтобы не восстанавливать первичку. Непрошедших перерегистрацию вряд ли будут закрывать автоматически, скорее всего это будет процедура через суд, а с судами никто не хочет связываться - слишком напряжно для налоговиков соблюсти все формальные процедуры. Так и будет Ваша фирма висеть мертвяком в их базе, пока Вы сами не явитесь или пока по Вам запрос какой-нибудь не придет и Вас не начнут разыскивать