Восстановление и корректировка НДС

[elios]

Подскажите, сложилась такая ситуация.
Работаем в Бухгалтерии 8.3, ОСНО+ЕНВД.
При поступление товара 4шт допустим в 3-ем квартале 2014г, НДС с данного товара был принят к вычету (весь НДС составлял 2000руб). При продаже данного товара в 4-том квартале в розницу этого же года, в размере 2шт, создалась проводка по восстановлению НДС в размере 1000. При формирование книги покупок в графе НДС по документу, сумма все равно осталась 2000- как и должно быть, т.к. НДС восстанавливается другими проводками.
Вся загвостка в том, что в случае когда и приход товара и продажа его в розницу, происходит в одном квартале. Сумма НДС в самом документе так и остается 2000, а вот в книге покупок она отображается за минусом 1000, и действие в самой базе уже называется не восстановление НДС, а корректировка.
Сведя все это в кучу, я так понимаю второй вариант неверный, т.к. при сверке в налоговой НДС с поставщиком данные будут отличаться.

Кто может сталкивался с такой проблемой, потому как согласно сведений МинФина, второй вариант верный, но я никак не могу понять, как тогда у них может пройти сверка контрагентов (даже в бумажном виде, документы не будут совпадать с книгой покупок), т.к. в отчетность попадают те же данные с корректировкой.
Подскажите, кто чем может.