НДС к вычету с полученного аванса (срок)

[BMK]

Не совсем понятно - этот аванс больше задолженности по второму договору, т. е. сводное сальдо в их пользу?
Если это так, то я их понимаю - зачем им все эти лишние телодвижения.
Я бы сделала с ними акт сверки в разрезе договоров, потом взяла бы с них письмо текущей датой с просьбой зачесть переплату по одному договору в счет погашения задолженности по второму и вернуть остаток. Чтобы быть уверенной что все будет сделано так как мне нужно - сделала бы эти бумаги сама, им бы дала только подписать.
Провела бы у себя ручной проводкой эту переброску, разницу вернула.
Датами переброски и возврата соответствующими частями поставила бы авансовый счет-фактуру к вычету в книгу покупок.