Заморочка с отчетом в пенсионный фонд

[Mila20]

Здравствуйте.
Я не работаю на участке заработной платы, но меня попросила бухгалтер с этого участка задать вопрос.
Ситуация такая:
Сотрудница ушла в отпуск, допустим с первого числа месяца. Получила отпускные за весь отпуск. Затем, через 2 недели отпуска пришла и написала заявление на увольнение. Её уволили 13-м числом. Провели это в программе и получилось, что эта сотрудница осталась должна предприятию деньги за оставшуюся половину отпуска. Главный бухгалтер сказала что разберется позже и забыла. А теперь в отчете в пенсинный фонд формируется задолженность на эту сумму. Подскажите, где были сделаны ошибки? Что надо сделать в данной ситуации?
Наше предприятие для расчета заработной платы пользуется программой Овионт.