Вы корректировкой хотите. Может проще выписать заново?
Регламент изменения цены, в ходе которой выставляется корректировочная счет-фактура предполагает отражать разницу.
Кроме того, по документам поступления может возникнуть ситуация, когда товар который ранее поставлялся уже продан. Его сторнирование и выписка по новой чревато /тем более в оперативном учете 1С: Комплексная/ тут одними проводками и не исправить. Если кому-то интересно - вот к чему пришел:
1) если товар по первичному документу еще НЕ ПРОДАН /висит на 41 счете/, то создаем НА ОСНОВАНИИ него документ поступление доп расходы и вбиваем разницу, которую нам дал поставщик /она может быть положительной и отрицательной /здесь исправил через конфигуратор возможность установки отрицательных значений/, во втором случае ставим количество в табличной части с минусом/
2) если товар уже ПРОДАН к этому времени, то нам нет нужды разбираться с партиями, однако появляется необходимость исправить фин. результат - здесь на разницу, которую выставил нам поставщик делаем документ корректировку долга поставщика и в качестве корр. счета ставим 90.2 или 91.2 - в зависимости от "ваших личных предпочтений"
3) плохой вариант - когда продана часть товара из документа основания, а часть лежит на складе - тут есть один вариант, я пока над ним думаю - решение похоже на танец с бубнами