НДФЛ перечислен НЕ по месту расположения обособленного подразделения.

[Аланда]

angel_, какая еще есть отчетность по ОП,где видно,что подразделение уже работало?

Сообщение от angel_

не должна ли зарплата сотрудников работающих на два подразделения делиться пропорционально для исчисления/уплаты налогов по НДФЛ.

Не могу вам ответить на вопрос,не задумывалась на эту тему.
Мне кажется,что это может иметь значение,если ОП находится в другом муниципальном образовании,которое заинтересовано в получении денег в свой бюджет.У вас же одно МО и разница только в КПП-код постановки на учет, а деньги попадают на счет одного МО.
Хотя есть действительно письма МФ (http://www.eg-online.ru/document/regulatory/73315/)
о том,что уплачивать НДФЛ можно одним платежным поручением ,если у головной организации и ОП совпадают и МО и КПП,но в вашем случае может быть и не наказуемо..ИМХО (как всегда)

В общем понятнее не стало