Разные суммы НДС по чекуи счёт-фактуре

[Наталья_58]

При приёме от нас налички Поставщик выдал чек и ПКО с одной суммой НДС, а в счёт-фактуре и накладной другая.
Разница возникла из-за того, что используются две ставки 10% и 18%.
У них нет возможности отразить в чеке и ПКО две ставки, поэтому забивают 18%. Следовательно налог к вычету выше.
Я понимаю, что основным документом для вычета по НДС является счёт-фактура.
Тогда мне придётся отслеживать уплаченный налог по чекам для определения базы для начисления налога на доходы для ИП раз он другой, отличается от накладной.У ИП кассовый метод признания Д и Р.
Кто-нибудь сталкивался с такой ситуацией?