Еще вот что заметила (хотя это не имеет отношения к з/пл)

Для счета 20 указана ном.группа "оплата труда" - как у вас закрывается счет 20? на эту сумму он не должен закрываться...
А по теме - дааа загадка. Пожалуй тут без вашей базы и не разберешься, пока мне больше ничего не приходит на ум. Вы точно открывали и проводили документ Начисление налогов/взносов с ФОТ? ... или вы перезапускали Закрытие месяца целиком? ... оно не всегда проводит документы ... попробуйте принудительно провести документ по начислению взносов (Зарплата/ Начисление налогов/ взносов с ФОТ)