Договор комиссии,ЕНВД и "каша в голове"

[misska]

Добрый день,уважаемые форумчане. Попробую написать по порядку,т.к. у самой уже непонятно что в голове...

Мы,ООО "Ромашка"(комиссионер) заключили договор комиссии с ООО "Василёк"(комитент).

ООО "Ромашка" - ЕНВД
ООО "Василек" - ОСНО.

Дело вот в чём.Всё это происходило в конце 3 квартала.И бухгалтер ООО "Василек" по незнанию (или что там еще у неё было )выписала разом товарные накладные и счет-фактуры.Соответственно они заплатили НДС и на этом успокоились.

А я теперь в шоке)Т.к. по моим то планам все должно было быть так:
ООО "Василек" отгружает нам - ООО "Ромашка" товар на комиссию и выписывает товарные накладные.
Затем по итогам квартала ООО "Ромашка" делает отчет комиссионера (так в договоре прописано),отправляет его в ООО "Василек",а те согласно отчета выписывают счет-фактуру и платят НДС.
Они сейчас мне говорят что ничего переделывать не будут.А я совсем запуталась...Разве могли они выставить счет-фактуры и НДС заплатить,если не было факта продажи???