ВЫ не правы. При спец режимах действует особый порядок возмещения. Б/л считаете как обычно, а вот расчет возмещения делаете за весь срок б/л, но исходя из МРОТ (2300р).У ВАс получится разница м/у реальной суммой б/л и суммой, полученной от ФСС. На сумму этой разницы Вы уменьшаете налог по УСН или ЕНВД (сумма б/л, выплаченная из собственных ср-в работодателя).
Есть очень хороший сайт ФСС: http://fz122.fss.ru . Там расчет б/л и возмещения делается автоматически, только нужно там зарегистрироваться.