Давний спор про УСН и выставление сч-ф с НДС имеет решение.

[Romana]

С-ф выставляем по просьбе организации.
Сама нашла ответ на свой вопрос, может кому поможет:

Раздел 3 декларации не заполняется в соответствии с «Порядком заполнения налоговой декларации по налогу на добавленную стоимость», являющуюся приложением №2 к Приказу Министерства финансов Российской Федерации от 15.10.2009 N 104н

34.3. По строкам 030 - 040 отражаются суммы налога, исчисленные к уплате в бюджет за налоговый период, которые зачисляются на указанный в строке 020 код бюджетной классификации.
По строке 030 отражается сумма налога, исчисленная к уплате в бюджет за налоговый период в соответствии с пунктом 5 статьи 173 Кодекса, которая подлежит уплате в бюджет в соответствии с порядком, определенным пунктом 4 статьи 174 Кодекса. Сумма налога, указанная по строке 030, не отражается в разделе 3 декларации и не участвует в расчете показателей по строкам 040 и 050.